Bản đồ liên kết vùng mục tiêu những QTL điều khiển việc cải tiến thành tế bào cây bắp
Nguồn: Theoretical and Applied Genetics, Volume 126, Issue 5, May 2013, p.1151-1165
Audrey Courtial và ctv. thuộc INRA, Pháp đã tiến hành nghiên cứu nhiều QTL có liên quan đến tính trạng phân rả của thành tế bào và hàm lượng lignin, trước đây họ đã tìm thấy trong quần thể con lai cận giao tái tổ hợp (RIL) của tổ hợp lai F288 × F271, bao gồm những QTL chủ lực định vị tại bin 6.06. Họ gặp trở ngại vì khi giải trình tự alen của các gen định vị xung quan vị trí “bin 6.06”, người ta ghi nhận đó là một vùng đơn hình (monomorphous), như vậy các QTL này giống như những bóng ma thoạt ẩn, thoạt hiện (ghost QTLs). Người ta thực hiện kỹ thuật “refining” (bản đồ phân giải cao) vùng của những QTL được tìm thấy trong quần thể, trên cơ sở tạo ra một sự dầy đặt của bản đồ liên kết (linkage map densification) đối với hầu hết những QTL quan trọng, ngay cả ở nhiều vùng chưa được đánh dấu. Kỹ thuật phân tích lập lại các dữ liệu (re-analysis) với một bản độ di truyền có cải tiến (173 markers thay vì 108) cho thấy những QTL bóng ma này định vị ở bin 6.06 được phân ra thành hai vị trí QTL có mặt ở upstream và downstream của vùng đa hình. Vùng trên của bin 0.06 (upstream of bin 6.06) mang những QTL chủ lực, giải thích được 37 - 59 % biến thiên kiểu hình và kéo dàichỉ trong 6 cM, tương đương với khoảng cách vật lý 2.2 Mbp. Trong 92 gen hiện diện ở vùng tương ứng của genome tham khảo cây bắp số B73, chín gen có thể được xem xét như nguyên nhân của việc hình thành tha2nhte61 bào thứ cấp [bHLH, FKBP, laccase, fasciclin, zinc finger C2H2-type và C3HC4-type (hai gen), NF-YB, và WRKY]. Hơn nữa, trên cơ sở bản đồ di truyền có cải tiến như vậy, tám QTLs được phát hiện trong bin 4.09, trong khi đ1o, chỉ có một QTL được ghi nhận bước đầu. Ảnh hưởng tương tác epistasis có ý nghĩa đối với tất cả tính trạng giữa những QTLs này tại bin 4.09 và hai QTLs chủ lực tại bin 6.05. Ba gen có quan hệ với thành tế bào thứ cấp là ZmMYB42, COV1-like, PAL-like hỗ trợ tích cực cho những quãng chứa QTL ở vùng bin 4.09. Kết quả nghiên cứu này, trên cơ sở con lai RIL, làm rõ sự tích cực của kỹ thuật “targeted marker mapping” trên bản đồ di truyền nhằm cải tiến vị trí chính xác của QTL.
No comments:
Post a Comment