CÂY NGÔ VIỆT NAM

Monday, July 24, 2023

Gen ứng cử viên “R3-MYB repressor Mybr97” và locus Anthocyanin3 của cây bắp

 Gen ứng cử viên “R3-MYB repressor Mybr97”  và locus Anthocyanin3 của cây bắp

Nguồn: Michael N. Paulsmeyer & John A. Juvik. 2023. R3-MYB repressor Mybr97 is a candidate gene associated with the Anthocyanin3 locus and enhanced anthocyanin accumulation in maize. Theoretical and Applied Genetics March 2023; vol. 136, Article number: 55 (2023); Published: 13 March 2023

 

Anthocyanin3 ức chế anthocyanin và chu trình monolignol trong cây bắp. Kỹ thuật “Transposon-tagging”, “RNA-sequencing”, và “GST-pulldown” xác định được anthocyanin3; nó có thể là protein  ức chế R3-MYB - gen Mybr97.

 

Anthocyanins là những phân tử màu sắcthu hút sự chú ý gần đây của chúng ta bởi vì những ích ích của nó đối với sức khỏe con người và những áp dụng như là những chất tạo màu tự nhiên (natural colorants) và dược phẩm nutraceuticals. Giống bắp tím đang được nghiên cứu ví nguồn vật liệu này rất kinh tế, cung cấp anthocyanins. Anthocyanin3 (A3) được biết là chất tăng cường thể lặn (recessive intensifier) của sắc tố anthocyanin trong cây bắp. Theo kết quả nghiên cứu này, hàm lượng anthocyanin được tăng lên gấp 100 lần trong cây bắp recessive a3.

 

Hình: Phổ biểu hiện anthocyanin trong hạt bắp (Peniche-Pavía et al. 2020).

 

Hai phương pháp tiếp cận được sử dụng để tìm thấy những ứng cử viên có trong cây bắp a3 intense purple. Thứ nhất, quần thể transposon-tagging quy mô lớn được người ta tạo ra với phân tử chèn đoạn Dissociation (Ds) ở cận gen Anthocyanin1. Một dòng đột biến de novo a3-m1::Ds được tạo ra, và phân tử chèn đoạn transposon này được tìm thấy định vị tại promoter của gen Mybr97, gen đồng dạng với gen R3-MYB repressor CAPRICE của cây mô hình Arabidopsis. Thứ hai, dùng quần thể “bulked segregant RNA-sequencing” để tìm thấy những khác biệt trong biểu hiện giữa pools của cây bắp green A3 và của cây bắp purple a3. Tất cả gen có trong sinh tổng hợp anthocyanin được định tính, chúng điều tiết theo kiểu “up” trong cây bắp a3 bên cạnh rất nhiều gen có trong chu trình monolignol. Gen Mybr97 điều tiết theo kiểu “down” trong cây bắp a3, cho thấy vai trò của nó là một regulator thụ động (negative regulator) trong chu trình anthocyanin. Biểu hiện gen liên quan đến quang tổng hợp bị giảm xuống trong cây bắp a3 thông quan một cơ chế chưa biết rõ ràng. Rất nhiều phân tử TFs (transcription factors) và các gen sinh tổng hợp cũng biểu hiện theo kiểu “up”, cần được nghiên cứu sâu hơn. Gen Mybr97 có thể ức chế sinh tổng hợp anthocyanin bởi gắn với phân tử protein TFs có mô típ helix–loop helix như Booster1. Nói chung, gen Mybr97 là gen ứng cử viên ưa thích nhất tại locus A3A3 có ảnh hưởng khá sâu  trong cây bắp, hàm ý trong bảo vệ cây trồng, sức khỏe con người, và sản phẩm có màu sắc trong tự nhiên.

 

Xem https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-023-04275-4

Khám phá gen mới hỗ trợ chọn tạo giống cây trồng thích ứng khí hậu

Khám phá gen mới hỗ trợ chọn tạo giống cây trồng thích ứng khí hậu 

Các nhà nghiên cứu lần đầu tiên đã tiết lộ cách thức một gen quan trọng trong thực vật cho phép chúng sử dụng năng lượng hiệu quả hơn, cho phép chúng phát triển nhiều rễ hơn và thu nhận được nhiều nước và chất dinh dưỡng hơn.

Một nhóm các nhà khoa học thực vật quốc tế do Đại học Penn State dẫn đầu và phối hợp với Đại học Nottingham đã phát hiện ra gen điều hòa mới này (được gọi là bHLH121) cho phép rễ cây ngô thu nhận được nhiều nước và chất dinh dưỡng hơn. Những phát hiện đã được công bố trong Proceedings of the National Academy of Science.

Gen này kiểm soát sự hình thành các khoảng không khí giữa các mô sống của rễ (được gọi là khí mô vỏ rễ). Việc thay thế một tỷ lệ lớn các tế bào rễ bằng các khoảng không giúp cây trồng tiết kiệm được rất nhiều năng lượng cần thiết để nuôi tất cả các tế bào rễ này. Điều này làm cho quá trình trao đổi chất của rễ trở nên hiệu quả hơn, cho phép chúng sử dụng các nguồn tài nguyên tiết kiệm được để hình thành nhiều rễ hơn và khám phá đất hiệu quả hơn, đồng thời thu được nhiều nước và chất dinh dưỡng hơn.

Các nhà nghiên cứu đề xuất phát hiện này có thể dẫn đến việc chọn tạo giống các loại cây trồng có thể chịu được hạn hán và điều kiện đất có hàm lượng đạm thấp, đồng thời giảm bớt tình trạng mất an ninh lương thực toàn cầu.

Rahul Bhosale, phó giáo sư về Bộ gen Chức năng Cây trồng từ Trường Khoa học Sinh học cho biết: "Việc xác định gen này và cách thức hoạt động của nó sẽ cho phép chúng tôi tạo ra các loại cây trồng dẻo dai hơn, có thể chịu được các điều kiện bất thuận về nước và dinh dưỡng do biến đổi khí hậu gây ra".

Nhóm nghiên cứu đã sử dụng các công cụ hình ảnh sắc bén được phát triển trong nghiên cứu trước đây tại Penn State để đo nhanh các tế bào trong hàng nghìn rễ. Một kỹ thuật hình ảnh được gọi là Chụp cắt lớp Laser Ablation rất quan trọng đối với phương pháp này. Phương pháp hiện đại này hiện cũng có sẵn tại Đại học Nottingham.

Hannah Schneider, phó giáo sư Sinh lý học Cây trồng tại Đại học & Nghiên cứu Wageningen, Hà Lan cho biết: "Chúng tôi lần đầu tiên thực hiện các thí nghiệm đồng ruộng trong nghiên cứu này bắt đầu từ năm 2010, trồng hơn 500 dòng ngô tại các địa điểm ở Pennsylvania, Arizona, Wisconsin và Nam Châu Phi. Tôi đã làm việc ở tất cả những địa điểm đó. Chúng tôi đã thấy bằng chứng xác định được một gen liên quan đến khí mô vỏ não rễ".

Nghiên cứu này cho thấy rằng các dòng ngô đột biến thiếu gen bHLH121 cho thấy sự hình thành khoảng trống ở rễ bị giảm. Ngược lại, biểu hiện quá mức bHLH121 gây ra nhiều không gian hình thành hơn.

Việc mô tả đặc điểm của các dòng này trong điều kiện lượng nước và đạm dưới mức tối ưu ở nhiều địa điểm cho thấy gen bHLH121 cần thiết cho sự hình thành khoảng không khí ở rễ và cung cấp một công cụ mới cho các nhà chọn tạo giống cây trồng để chọn các giống có khả năng cải thiện việc hấp thu dinh dưỡng đất và do đó cho năng suất trong các điều kiện dưới mức tối ưu.

Giáo sư Jonathan Lynch, trưởng nhóm nghiên cứu tại Penn State cho biết: “Những phát hiện này là kết quả của nhiều người tại Penn State và hơn thế nữa là các cộng tác viên làm việc trong nhiều năm qua. Chúng tôi đã phát hiện ra chức năng của đặc điểm aerenchyma và sau đó là gen liên quan đến nó và aerenchyma ra đời nhờ các công nghệ đã được phát minh ở đây tại Penn State, chẳng hạn như Shovelomics - đào sâu vào lĩnh vực này về giải phẫu và Chụp cắt lớp Laser Ablation Đường ống dẫn. Chúng tôi tập hợp tất cả những thứ đó lại với nhau trong công trình này”.

Lynch cho biết kết quả rất có ý nghĩa, bởi vì việc tìm ra một gen đằng sau một đặc điểm quan trọng sẽ giúp thực vật có khả năng chịu hạn tốt hơn và hấp thụ đạm và lân tốt hơn sẽ xuất hiện rất nhiều trong bối cảnh biến đổi khí hậu.

Ông cho biết: “Đó là những phẩm chất cực kỳ quan trọng kể cả ở Hoa Kỳ và trên toàn thế giới. Hạn hán là rủi ro lớn nhất đối với người trồng ngô và đang trở nên tồi tệ hơn cùng với biến đổi khí hậu và đạm là chi phí lớn nhất để trồng ngô, từ cả góc độ tài chính và môi trường. Việc lai tạo các dòng ngô hiệu quả hơn trong việc thu gom chất dinh dưỡng sẽ là một bước phát triển lớn”.

  

Xác định locus đột biến liên quan đến khí mô vỏ rễ ở rễ ngô. (A) Hình ảnh bề mặt cắt ngang của chân răng được chụp bằng cắt lớp cắt bỏ bằng laser (LAT). (B) Các kiểu hình giải phẫu gốc được định lượng bằng phần mềm RootScan. (C) Sơ đồ Manhattan về kết quả GWAS đối với aerenchyma vỏ não. Ngưỡng ý nghĩa trên toàn bộ nhiễm sắc thể (đường nằm ngang) được đặt bằng phương pháp M đơn giản (−log10p = 5,32). Các SNP quan trọng nằm trong mô hình gen GRMZM2G083504 (ZmbHLH121) mã hóa yếu tố phiên mã ZmbHLH121. (D) Biểu hiện tương đối của ZmbHLH121 trong tấm bia và vỏ của rễ chính từ cây ngô 3 tuổi. (Thanh tỷ lệ, 100µm.).

Nghiên cứu mới cho thấy hạn hán ảnh hưởng đến năng suất ngô như thế nào

Nghiên cứu mới cho thấy hạn hán ảnh hưởng đến năng suất ngô như thế nào

Một bắp ngô được tách vỏ sớm để lộ những râu ngô khi trổ hoa sớm. Hoa ngô độc đáo với mỗi hạt tạo ra từ một sợi râu ngô dài được thụ phấn. Nguồn: Tiến sỹ Raju Bheemanahalli.

 

Ngô là một loại cây trồng cổ điển của Mỹ. Được trồng lần đầu tiên ở Bắc Mỹ hàng ngàn năm trước, giờ đây nó phủ kín đất nông nghiệp của Mỹ từ bờ biển này sang bờ biển khác. Hoa Kỳ trồng nhiều ngô hơn bất kỳ quốc gia nào khác. Và ngô được sử dụng cho mọi thứ, từ khoai tây chiên đến thức ăn cho bò, đến nhiên liệu sinh học.

 

Nhưng giống như hầu hết các loại cây trồng, ngô đang phải đối mặt với nguy cơ mới – biến đổi khí hậu. Biến đổi khí hậu không chỉ làm cho thế giới ấm hơn. Nó cũng làm thay đổi thời điểm mưa và lượng mưa. Điều này khiến nhiều nông dân trồng ngô có nguy cơ phải đối mặt với hạn hán trong một giai đoạn của mùa vụ trồng trọt.

 

Thật không may, không phải tất cả hạn hán đều được tạo ra đều nhau. Nếu hạn xuất hiện sai thời điểm, toàn bộ cánh đồng có thể bị thiệt hại.

 

“Hạn hán nghiêm trọng trong giai đoạn ngô sinh trưởng sinh thực có thể làm cho mất mùa hoàn toàn. Vì vậy, hiểu được phản ứng của ngô đối với hạn hán và quản lý phù hợp là rất quan trọng để trồng ngô thành công”, Ranadheer Vennam, sinh viên tốt nghiệp khoa Khoa học Đất và Thực vật tại Đại học Bang Mississippi cho biết.

 

Kích thước lõi ngô giảm khi tăng hạn hán, dấu hiệu nghiêm trọng làm cho năng suất thấp hơn. Nguồn: Tiến sỹ Raju Bheemanahalli.

 

Vennam nghiên cứu cách thức ngô phản ứng với hạn. Trong nghiên cứu mới nhất của mình, Vennam và nhóm phòng thí nghiệm của ông đã xem xét mức độ nhạy cảm của ngô ra hoa đối với hạn và ảnh hưởng của nó đối với người nông dân.

 

Vennam đã trình bày công trình của mình tại cuộc họp thường niên của Hiệp hội Nông nghiệp Hoa Kỳ năm 2022, được tổ chức tại Baltimore, Maryland.

 

Sự ra hoa của ngô khá phức tạp. Mỗi noãn riêng lẻ tạo ra một sợi râu ngô rất dài, sợi râu ngô này phải thu giữ phấn hoa từ các bông cờ ở phía trên cây để tạo ra hạt. Điều này đòi hỏi sự phối hợp nhịp nhàng. Tiến sỹ Raju Bheemanahalli (người giám sát của Vennam) cho biết: “Việc sinh sản thành công ở ngô phụ thuộc vào thời điểm. Chỉ mất chưa đầy hai tuần để ngô thụ phấn, vốn cực kỳ nhạy cảm với các tác nhân gây căng thẳng, bao gồm hạn hán”.

 

 

Khi gặp hạn hán nghiêm trọng, sinh khối râu ngô ít hơn nhiều so với các trái ngô khỏe mạnh. Việc phun râu phải đúng thời điểm. Hạn hán đến vào thời điểm quan trọng này, có thể ảnh hưởng tiêu cực đến năng suất. Nguồn: Tiến sỹ Raju Bheemanahalli.

 

Để xác định tác động của hạn hán đối với quá trình này, nhóm của Vennam đã cho cây ngô tiếp xúc với hạn các mức độ khác nhau trong quá trình ra hoa. Họ đã tiến hành thử nghiệm tại Trung tâm Nghiên cứu Khoa học Thực vật R. R. Foil, Đại học Bang Mississippi. Trong thời gian ra hoa hai tuần, các nhà nghiên cứu đã giảm lượng nước mà mỗi cây nhận được. Trong thử nghiệm khắc nghiệt nhất, cây chỉ nhận được 20% lượng nước cần thiết.

 

Để theo dõi hạn ảnh hưởng đến cây ngô như thế nào, các nhà nghiên cứu đã đo lượng râu ngô phát triển mỗi ngày. Họ cũng đo năng suất cuối cùng và các tính trạng chất lượng quan trọng của hạt, chẳng hạn như lượng tinh bột và protein của chúng. Nghiên cứu của Vennam cũng theo dõi các khía cạnh quan trọng với sự phát triển của cây, chẳng hạn như hàm lượng diệp lục tố trong lá.

 

Khi bị hạn hán nghiêm trọng, các trái ngô tạo ra sinh khối râu ngô ít hơn nhiều so với các trái ngô khỏe mạnh. Số lượng râu ngô cũng thấp hơn khoảng một phần ba. Không có đủ râu ngô khỏe, bắp ngô không thể cho nhiều hạt. Vennam thấy rằng năng suất giảm 90% trong nghiệm thức hạn hán nghiêm trọng. Sự sụt giảm năng suất này là do sự sụt giảm nghiêm trọng cả về số lượng hạt và trọng lượng của mỗi hạt.

 

Như một phần của nghiên cứu trong thời gian ra hoa kéo dài hai tuần, các nhà nghiên cứu đã giảm lượng nước mà mỗi cây nhận được. Trong điều kiện hạn nặng (hình bên phải), chất lượng lõi ngô kém. Cả số lượng và trọng lượng của hạt đều giảm đáng kể. Nguồn: Ranadheer Vennam.

 

Để so sánh, các nhà nghiên cứu cũng đã thử nghiệm căng thẳng dài một tháng sau khi kết thúc ra hoa. Mặc dù đợt hạn hán này kéo dài hơn gấp đôi vào giai đoạn hạn này, nhưng năng suất không bị ảnh hưởng nhiều. Bheemanahalli cho biết: “Điều này minh họa mức độ nhạy cảm của giai đoạn phát triển sinh thực đối với hạn hán và thời điểm xảy ra hạn hán cũng như cách hạn ảnh hưởng đến sản lượng ngô”.

 

Với thông tin thu được từ nghiên cứu này, các nhà nghiên cứu hiện đang cố gắng làm cho cây ngô có khả năng chịu hạn tốt hơn. Bước tiếp theo là tìm ra gen di truyền của ngô có khả năng kiểm soát hạn tốt hơn một cách tự nhiên trong quá trình ra hoa. Nếu họ có thể thành công trong việc tìm ra những cây ngô chống chịu này hơn, các nhà di truyền có thể lai tạo những tính trạng này vào các giống ngô mà người nông dân muốn trồng. Kết quả có thể là các giống/giống ngô lai tốt hơn có thể thích nghi với khí hậu thay đổi. 

Một bắp ngô được tách vỏ sớm để lộ những râu ngô khi trổ hoa sớm. Hoa ngô độc đáo với mỗi hạt tạo ra từ một sợi râu ngô dài được thụ phấn. Nguồn: Tiến sỹ Raju Bheemanahalli.

 

Ngô là một loại cây trồng cổ điển của Mỹ. Được trồng lần đầu tiên ở Bắc Mỹ hàng ngàn năm trước, giờ đây nó phủ kín đất nông nghiệp của Mỹ từ bờ biển này sang bờ biển khác. Hoa Kỳ trồng nhiều ngô hơn bất kỳ quốc gia nào khác. Và ngô được sử dụng cho mọi thứ, từ khoai tây chiên đến thức ăn cho bò, đến nhiên liệu sinh học.

 

Nhưng giống như hầu hết các loại cây trồng, ngô đang phải đối mặt với nguy cơ mới – biến đổi khí hậu. Biến đổi khí hậu không chỉ làm cho thế giới ấm hơn. Nó cũng làm thay đổi thời điểm mưa và lượng mưa. Điều này khiến nhiều nông dân trồng ngô có nguy cơ phải đối mặt với hạn hán trong một giai đoạn của mùa vụ trồng trọt.

 

Thật không may, không phải tất cả hạn hán đều được tạo ra đều nhau. Nếu hạn xuất hiện sai thời điểm, toàn bộ cánh đồng có thể bị thiệt hại.

 

“Hạn hán nghiêm trọng trong giai đoạn ngô sinh trưởng sinh thực có thể làm cho mất mùa hoàn toàn. Vì vậy, hiểu được phản ứng của ngô đối với hạn hán và quản lý phù hợp là rất quan trọng để trồng ngô thành công”, Ranadheer Vennam, sinh viên tốt nghiệp khoa Khoa học Đất và Thực vật tại Đại học Bang Mississippi cho biết

 

Vennam nghiên cứu cách thức ngô phản ứng với hạn. Trong nghiên cứu mới nhất của mình, Vennam và nhóm phòng thí nghiệm của ông đã xem xét mức độ nhạy cảm của ngô ra hoa đối với hạn và ảnh hưởng của nó đối với người nông dân.

 

Vennam đã trình bày công trình của mình tại cuộc họp thường niên của Hiệp hội Nông nghiệp Hoa Kỳ năm 2022, được tổ chức tại Baltimore, Maryland.

 

Sự ra hoa của ngô khá phức tạp. Mỗi noãn riêng lẻ tạo ra một sợi râu ngô rất dài, sợi râu ngô này phải thu giữ phấn hoa từ các bông cờ ở phía trên cây để tạo ra hạt. Điều này đòi hỏi sự phối hợp nhịp nhàng. Tiến sỹ Raju Bheemanahalli (người giám sát của Vennam) cho biết: “Việc sinh sản thành công ở ngô phụ thuộc vào thời điểm. Chỉ mất chưa đầy hai tuần để ngô thụ phấn, vốn cực kỳ nhạy cảm với các tác nhân gây căng thẳng, bao gồm hạn hán”.

 

Để xác định tác động của hạn hán đối với quá trình này, nhóm của Vennam đã cho cây ngô tiếp xúc với hạn các mức độ khác nhau trong quá trình ra hoa. Họ đã tiến hành thử nghiệm tại Trung tâm Nghiên cứu Khoa học Thực vật R. R. Foil, Đại học Bang Mississippi. Trong thời gian ra hoa hai tuần, các nhà nghiên cứu đã giảm lượng nước mà mỗi cây nhận được. Trong thử nghiệm khắc nghiệt nhất, cây chỉ nhận được 20% lượng nước cần thiết.

 

Để theo dõi hạn ảnh hưởng đến cây ngô như thế nào, các nhà nghiên cứu đã đo lượng râu ngô phát triển mỗi ngày. Họ cũng đo năng suất cuối cùng và các tính trạng chất lượng quan trọng của hạt, chẳng hạn như lượng tinh bột và protein của chúng. Nghiên cứu của Vennam cũng theo dõi các khía cạnh quan trọng với sự phát triển của cây, chẳng hạn như hàm lượng diệp lục tố trong lá.

 

Khi bị hạn hán nghiêm trọng, các trái ngô tạo ra sinh khối râu ngô ít hơn nhiều so với các trái ngô khỏe mạnh. Số lượng râu ngô cũng thấp hơn khoảng một phần ba. Không có đủ râu ngô khỏe, bắp ngô không thể cho nhiều hạt. Vennam thấy rằng năng suất giảm 90% trong nghiệm thức hạn hán nghiêm trọng. Sự sụt giảm năng suất này là do sự sụt giảm nghiêm trọng cả về số lượng hạt và trọng lượng của mỗi hạt.

 

Như một phần của nghiên cứu trong thời gian ra hoa kéo dài hai tuần, các nhà nghiên cứu đã giảm lượng nước mà mỗi cây nhận được. Trong điều kiện hạn nặng (hình bên phải), chất lượng lõi ngô kém. Cả số lượng và trọng lượng của hạt đều giảm đáng kể. Nguồn: Ranadheer Vennam.

 

Để so sánh, các nhà nghiên cứu cũng đã thử nghiệm căng thẳng dài một tháng sau khi kết thúc ra hoa. Mặc dù đợt hạn hán này kéo dài hơn gấp đôi vào giai đoạn hạn này, nhưng năng suất không bị ảnh hưởng nhiều. Bheemanahalli cho biết: “Điều này minh họa mức độ nhạy cảm của giai đoạn phát triển sinh thực đối với hạn hán và thời điểm xảy ra hạn hán cũng như cách hạn ảnh hưởng đến sản lượng ngô”.

 

Với thông tin thu được từ nghiên cứu này, các nhà nghiên cứu hiện đang cố gắng làm cho cây ngô có khả năng chịu hạn tốt hơn. Bước tiếp theo là tìm ra gen di truyền của ngô có khả năng kiểm soát hạn tốt hơn một cách tự nhiên trong quá trình ra hoa. Nếu họ có thể thành công trong việc tìm ra những cây ngô chống chịu này hơn, các nhà di truyền có thể lai tạo những tính trạng này vào các giống ngô mà người nông dân muốn trồng. Kết quả có thể là các giống/giống ngô lai tốt hơn có thể thích nghi với khí hậu thay đổi.